11 Eylül 1988'de Sakarya'nın Akyazı ilçesinde dünyaya gelmiştir. Futbola 1999'da Topağaçspor'da başlayan Pektemek 2004 yılına kadar bu takımın altyapısında forma giydi. 2004'de Akyazıspor 2005'de Sakaryaspor altyapısına transfer oldu. Sakaryaspor Paf takımında oynadığı futbol ile dikkat çekti ve A takım antrenmanlarına alındı. 2006'da profesyonel sözleşme imzaladı. 2007'de Sarıyer'e kiralandı 15 maçta 4 gol kaydetti. 2008-2009 sezonunda Gençlerbirliği'ne transfer oldu. Gençlerbirliği'nde 3 sezon forma giydi ve 67 maça çıktı 24 de gol kaydetti. Başarılı performansı Beşiktaş'ın dikkatini çekti ve 27 Mayıs 2011'de Beşiktaş'a transfer oldu ve hala formasını giymektedir.